Сентябрь является переходным месяцем от лета к осени. Уже нет летнего зноя, но ещё много солнечных сухих дней и достаточно тепло. В первой половине месяца преимущественно ясная, теплая, порой жаркая, погода. Во второй половине сентября температура воздуха понижается, жаркие дни маловероятны, в степных и предгорных районах в ночное время наблюдаются первые заморозки в воздухе и на поверхности почвы, обусловленные вторжением холодного воздуха арктического происхождения.
По данным Федерального государственного бюджетного учреждения «Крымское управление по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды», среднемесячная температура воздуха в сентябре +16,+19º. Абсолютный максимум температуры воздуха составляет +34˚,+39˚, на побережье +33˚, +37˚. Абсолютный минимум температуры воздуха в степных и предгорных районах колеблется от 0º до 7˚мороза, а западном и южном побережьях в пределах от 1° мороза до 4° тепла.
Осадки в сентябре бывают ливневые и обложные, связанные с прохождением через Крым циклонов или волновых возмущений, чаще всего с запада, что характерно для осени. Среднемесячное количество осадков составляет 28-40 мм, в горных районах 59-65 мм. Месячный максимум осадков достигает 94-210 мм, в горах 365 мм. Грозы наблюдаются 2-3 случая в месяц.
Ветер у земли преобладает северо-восточный и восточный. Средняя скорость ветра 2-6 м/с. Ветер более 15 м/с отмечается 1-5 случаев в месяц. В отдельные годы штормовой ветер в сентябре отсутствует.
Туманы наблюдаются 1-4 раза в месяц, в горах чаще 6-11 раз в месяц, на ЮБК в сентябре туманы отсутствуют.
По прогнозам синоптиков, в сентябре 2016 года среднемесячная температура воздуха ожидается около нормы, при норме 17,2 °С. Месячное количество осадков ожидается меньше нормы (норма 36 мм).